產(chǎn)品簡(jiǎn)介
Small RNA是一類長(zhǎng)度在18-30nt范圍的調(diào)控因子，在基因表達(dá)調(diào)控、生物個(gè)體發(fā)育、代謝及疾病的發(fā)生等生理過(guò)程中起著重要的作用。
研究?jī)?nèi)容
1) 測(cè)序質(zhì)量值分布統(tǒng)計(jì)；
2) 測(cè)序堿基質(zhì)量控制；
3) 測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì)；
4) 樣品間公共及特有序列分析（兩個(gè)或兩個(gè)樣品以上）；
5) 與參考序列進(jìn)行比對(duì)；
6) 與相關(guān)生物數(shù)據(jù)庫(kù)（miRBASE、RepBASE、Rfam、SILVA、ncRNAs等）及參考基因組比對(duì)，分類注釋Small RNA；
7) miRNA鑒定：已知miRNA鑒定；
8) miRNA長(zhǎng)度分布分析；
9) miRNA基因組分布分析（針對(duì)有ref物種）；
10) 預(yù)測(cè)新miRNA及二級(jí)結(jié)構(gòu)模式圖繪制；
11) miRNA堿基偏好性分析；
12) miRNA堿基編輯分析；
13) miRNA家族分析；
14) miRNA定量分析；
15) miRNA差異表達(dá)分析：重復(fù)相關(guān)性檢測(cè)；差異表達(dá)篩選；差異表達(dá)miRNA統(tǒng)計(jì)；
16) 差異表達(dá)miRNA篩選；
17) 差異表達(dá)miRNA聚類分析；
18) miRNA靶基因預(yù)測(cè)；
19) 差異表達(dá)miRNA靶基因注釋；
20) 差異表達(dá)miRNA靶基因的GO分類；
21) 差異miRNA靶基因GO富集層次分析；
22) 差異miRNA靶基因的COG注釋；
23) 差異miRNA靶基因KEGG注釋；
24) 差異miRNA靶基因KEGG通路富集分析。
結(jié)果展示
送樣建議
1) 樣品類型：總RNA；
2) 樣品濃度：≥50ng/μg；
3) RNA總量：≥3μg；
4) RNA純度：OD260/280：1.8-2.0；OD260/230≥1.8，260處有正常峰值；
5) RNA完整度：電泳檢測(cè)28s/18s≥1.5或RIN≥7.5（動(dòng)物）、7（植物、真菌），基線平整（軟體等無(wú)28S物種）。
